这是命令 fastaq-to_tiling_bam 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
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fastaq_to_tiling_bam - 制作一个 BAM 文件,读取均匀分布在输入中
参考
商品描述
用法:fastaq_to_tiling_bam [选项]
获取一个序列文件。 制作一个包含完美(未配对)读取的 BAM 文件平铺
全基因组
阵地 参数:
infile 输入 fasta/q 文件的名称
读取长度
读取长度
读步骤
每次读取开始之间的距离
读前缀
读取名称的前缀
输出文件
输出 BAM 文件的名称
可选 参数:
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出
--qual_char 质量字符
用于质量得分的字符 [I]
--读取组 阅读组
将给定的读取组 ID 添加到所有读取 [42]
重要提示:假设 samtools 在您的路径中
使用 onworks.net 服务在线使用 fastaq-to_tiling_bam