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fastq-clipper - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 fastq-clipper

这是命令 fastq-clipper,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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fastq-clipper - ea-utils:从 fastq 文件中删除一个或多个适配器序列

商品描述


用法:fastq-clipper [选项]

从 fastq 文件中删除一个或多个适配器序列。 适配器序列是
冒号分隔。 统计数据转到标准错误,除非 -o 已指定。

配置


-h 这个帮助

-o FIL 输出文件(统计到标准输出)

-p N 最大差异百分比 (10)

-m N 最小夹子长度 (1)

-l N 最小剩余序列长度 (15)

-x [N] 超过适配器长度的额外匹配长度,

N =-1 : 搜索所有 N = 0 : 只搜索适配器长度

-e 行尾(默认)

-b 行首(尚不支持)

使用 onworks.net 服务在线使用 fastq-clipper


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