这是 getorfe 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
getorf - 查找并提取开放阅读框 (ORF)
概要
格托夫 -序列 后继 [-表 名单[-最小 整数[-最大尺寸 整数[-找 名单]
-蛋氨酸 布尔 -圆 布尔 -逆转 布尔 -侧翼 整数
-outseq 后序器
格托夫 -救命
商品描述
格托夫 是来自 EMBOSS（“欧洲分子生物学公开赛”）的命令行程序
软件套件”）。 它是“核：基因发现”命令组的一部分。
配置
输入 部分
-序列 后继
额外 部分
-表 名单
-最小 整数
默认值：30
-最大尺寸 整数
默认值：1000000
-找 名单
这是一个可能的输出选项的小菜单。 前四个选项是选择
蛋白质翻译或开放的原始核酸序列
阅读框。 开放阅读框有两种可能的定义：它可以
要么是一个没有终止密码子的区域，要么是一个以 START 开头的区域
密码子并以终止密码子结尾。 最后三个选项可能只是感兴趣
希望调查周围区域的统计特性的人
潜在的起始或终止密码子。 最后一个选项假设 ORF 长度为
在两个终止密码子之间计算。
先进的 部分
-蛋氨酸 布尔
蛋白质产品开头的 START 密码子通常编码蛋氨酸，
尽管密码子在蛋白质内部时会编码什么。 这个预选赛
默认情况下，将所有此类 START 密码子设置为编码蛋氨酸。 默认值：是
-圆 布尔
默认值：N
-逆转 布尔
如果您不想在反向补充中找到 ORF，则将此设置为 false
序列。 默认值：是
-侧翼 整数
如果您选择了要查找的序列类型的选项之一，
STOP 或 START 密码子周围的侧翼序列，这允许您设置
该密码子两侧的核苷酸输出。 如果侧翼核苷酸区域
穿过序列的开头或结尾，没有给出该密码子的输出。 默认
值：100
输出 部分
-outseq 后序器
使用 onworks.net 服务在线使用 getorfe
