这是 gt-orffinder 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
gt-orffinder - 识别序列中的 ORF（开放阅读框）。
概要
gt 寻路者 [选项...] [索引名称] [GFF3_file ...]
商品描述
类型
指定应该搜索开放阅读框的区域，例如
LTR_逆转录转座子
-allorfs [是|否]
搜索所有 ORF 而不是最长的（默认：否）
-分钟 [折扣值]
ORF 的最小长度（默认：30）
-最大限度 [折扣值]
ORF 的最大长度（默认值：10000）
-v [是|否]
详细（默认：否）
-o [文件名]
将输出重定向到指定文件（默认值：未定义）
-gzip [是|否]
写入 gzip 压缩输出文件（默认：无）
-bzip2 [是|否]
写入 bzip2 压缩输出文件（默认：无）
-力 [是|否]
强制写入输出文件（默认值：否）
-seq文件 [文件名]
设置从中获取序列的序列文件（默认值：未定义）
-encseq [文件名]
设置从中获取序列的编码序列索引名（默认值：
不明确的）
-seq文件
设置从中提取特征使用的序列文件 -- 终止列表
序列文件
-matchdesc [是|否]
从输入文件的序列描述中搜索所需的序列 ID（在
GFF3)，报告第一场比赛（默认：无）
-matchdesc开始 [是|否]
与所需序列的输入文件中的序列描述完全匹配
从开头到第一个空格的 ID（在 GFF3 中）（默认值：无）
-usedesc [是|否]
使用序列描述将序列 ID（在 GFF3 中）映射到实际序列
条目。 如果描述包含序列范围（例如，III:1000001..2000000），则
第一部分用作序列 ID (III) 和第一个范围位置作为偏移量
(1000001)（默认值：否）
-区域映射 [绳子]
将包含序列区域的文件设置为序列文件映射（默认值：未定义）
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-orffinder
