这是 gt-repfind 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
gt-repfind - 计算最大精确匹配（以及更多）。
概要
gt 重新查找 [选项] -ii 索引名
商品描述
-l [折扣值]
指定匹配的最小长度（默认值：0）
-f [是|否]
计算前向匹配（默认：是）
-r [是|否]
计算反向匹配（默认：否）
-p [是|否]
计算反向链上的匹配（默认值：否）
-种子长度 [折扣值]
指定种子的最小长度（默认值：0）
-最大频率 [折扣值]
指定参考序列中最大精确匹配的最大频率（默认值：0）
-extendxdrop [折扣值]
使用xdrop算法将种子扩展到双方，可选参数指定
灵敏度（默认值：97）
-xdrop低于 [折扣值]
指定 xdrop 截止分数（参数 0 表示未定义）。 如果未定义最佳值
根据错误率自动确定
-扩展贪婪 [折扣值]
使用带有修剪波浪的贪心算法将种子扩展到两侧，可选
参数指定灵敏度（默认值：97）
-身份认同 [折扣值]
将匹配的最小标识指定为 70 到 99 范围内的整数（对于 xdrop
和贪婪的扩展）（默认值：80）
-a [折扣值]
显示精确匹配的对齐/序列（可选参数是列数
每行）（默认值：70）
-ii [绳子]
指定输入索引（默认：未定义）
-扫描 [是|否]
扫描索引而不是将其映射到主内存（默认值：否）
-v [是|否]
详细（默认：否）
-救命
显示帮助并退出
-版
显示版本信息并退出
REPORTING BUGS
将错误报告给[电子邮件保护]>.
使用 onworks.net 服务在线使用 gt-repfind
