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hmm2convert - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 hmm2convert

这是命令 hmm2convert,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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hmm2convert - 在配置文件 HMM 文件格式之间转换

概要


嗯2转换 [选项] 旧文件 新的hmm文件

商品描述


嗯2转换 从中读取 HMM 文件 旧文件 以任何 HMMER 格式,并将其写入新的
文件 新的hmm文件 以一种新的形式。 旧文件新的hmm文件 必须是不同的文件; 你
不能可靠地覆盖旧文件。 默认情况下,新的 HMM 文件是用 HMMER 2 编写的
ASCII 格式。

可用格式为 HMMER 2 ASCII(默认)、HMMER 2 二进制 (-b) GCG简介 (-p)
Compugen XSW 扩展配置文件 (-P)。

配置


-a 转换为 HMMER 2 ASCII 文件。 这是默认设置,因此不需要此选项。

-b 转换为 HMMER 2 二进制文件。

-h 打印简要帮助; 包括版本号和所有选项的摘要,包括
专家选项。

-p 转换为 GCG 配置文件 .prf 格式。

-A 追加模式; 附加到 新的hmm文件 而不是创建一个新文件。

-F 力量; 如果 新的hmm文件 已经存在,并且 -A 未用于附加到
文件,hmm2convert 将拒绝破坏现有文件,除非 -F 用来。

-P 将 HMM 转换为 Compugen XSW 扩展配置文件格式,类似于 GCG
profile 格式,但有两个额外的列用于删除打开和删除扩展成本。
(我不相信 Compugen 公开支持这种格式;它可能是
无证。)

使用 onworks.net 服务在线使用 hmm2convert


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