这是 macs2_bdgbroadcall 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
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macs2_bdgbroadcall - 基于模型的 ChIP 测序分析
商品描述
用法：macs2 bdgbroadcall [-h] -i IFILE [-c CUTOFFPEAK] [-C CUTOFFLINK]
[-l MINLEN] [-g LVL1MAXGAP] [-G LVL2MAXGAP]
[--outdir OUTDIR] (-o 文件 | --o-前缀 前缀）
可选 参数：
-h, - 帮帮我
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-i 文件， --i文件 文件
在 BedGraph 中的 MACS 分数。 必需的
-c 截止峰值， --截止峰值 截止峰值
峰值的截止取决于您用于乐谱跟踪的方法。 如果文件
包含来自 MACS2 的 qvalue 分数，分数 2 表示 qvalue 0.01。 默认：2
-C 切断链接， --截止链接 切断链接
连接区域/低丰度区域的截止值取决于您使用的方法
用于得分轨道。 如果文件包含来自 MACS2 的 qvalue 分数，分数 1 表示
qvalue 0.1，score 0.3 表示 qvalue 0.5。 默认：1
-l 敏伦， --最小长度 民伦
峰的最小长度，最好将其设置为 d 值。 默认值：200
-g LVL1最大差距， --lvl1-最大间隙 LVL1最大间隙
重要峰之间的最大间隙，最好将其设置为标签大小。 默认值：30
-G LVL2最大差距， --lvl2-最大间隙 LVL2最大间隙
显着峰之间的最大连接，最好将其设置为 d 值的 4 倍。
默认值：800
--outdir 外向
如果指定，则所有输出文件都将写入该目录。 默认值：
当前工作目录
-o 文件， --o文件 文件
输出文件名。 与互斥 --o-前缀.
--o-前缀 前缀
输出文件前缀。 与互斥 -o/--文件。
使用 onworks.net 服务在线使用 macs2_bdgbroadcall
