这是命令 pacoxph,可以使用我们的多个免费在线工作站之一(例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器)在 OnWorks 免费托管提供商中运行
程序:
您的姓名
pacoxph - 使用 Cox 比例风险模型执行全基因组关联分析
概要
帕考夫 [ 命令行 选项 ]
商品描述
帕考夫 以有效的方式对大型插补数据集运行线性回归。
附加选项
其他要求 命令 线 选项
-p, --现象 文件
从中读取表型数据 文件
-一世, - 信息 文件
从中读取 SNP 信息 文件 (例如 MLINFO 文件)。
-d, - 剂量 文件
SNP 预测器(例如 MLDOSE/MLPROB)文件名。
可选 命令 线 选项
-米, - 地图 文件
映射文件名,包含每个 SNP 的碱基对位置。
-n, --nids NUMBER
要分析的人数。
-C, --铬 文件
染色体(要传递到输出)。
-o, - 出去 文件
输出文件名(默认为 回归.out.txt ).
-是的, --跳过 NUMBER
在预测器(剂量/概率)文件中要跳过多少列(默认为 2)。
-t, --特性 NUMBER
分析了多少特征(默认为 2)。
-G, --ngpreds NUMBER
每个标记有多少预测变量列(默认 1 = MLDOSE;否则使用 2 表示 MLPROB)。
-一种, --分离 文件
分隔字段的字符(默认为空格)。
-r, - 分数
使用分数测试。
-e, --无头
不要在输出中报告标题行。
-l ——阿尔科夫
报告所有协变量的估计值(大输出!)。
-b, - 相互作用
用于与 SNP 分析交互的协变量(默认为 no
互动,0)。
-k, --仅交互
喜欢 - 相互作用 但没有与 SNP 相互作用的协变量(默认为
无交互,0)。
- 帮帮我 打印帮助。
使用 onworks.net 服务在线使用 pacoxph