这是 pls2fasta 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
您的姓名
pls2fasta - 将 plx.h5/bax.h5/fofn 文件转换为 fasta 或 fastq 文件
概要
pls2法斯塔 在.bax.h5 出.fasta [选项]
商品描述
尽管每次运行都提供了 fasta 文件，但它们不会被修剪或拆分为
子阅读。 这个程序需要额外的注释信息，例如子阅读
坐标和高质量区域，并使用它们来创建 fasta 序列
调用的所有碱基的子串。 大多数时候，你会想要修剪低质量的读取，
所以你应该指定 -按区域修剪.
配置
在.bax.h5
输入 plx.h5/bax.h5/fofn 文件。
出.fasta
输出 fasta/fastq 文件。
-按区域修剪
修剪掉低质量的区域。
-maskByRegion
用“N”掩盖低质量区域。
-区域表 折扣值
可选的 HDF 文件 /PulseData/区域 数据集。
-minSubreadLength 折扣值
不要写入小于指定长度的子读取。
-noSplitSubreads
不要在适配器序列上拆分读取。
-孔数
仅打印此孔编号（或编号列表）。
-fastq 以高质量的 FASTQ 格式打印。
-ccs 打印从头循环共识 (ccs) 序列
-线长 折扣值
指定 fasta/fastq 行长度
-minReadScore 折扣值
打印阅读的最低阅读分数。 分数是一个介于 0 到 1000 之间的数字，并且
表示预期的准确率百分比 * 10。典型值介于
750 和 800。这不适用于 ccs 读取。
-最好 如果存在 ccs 序列，请打印此内容。 否则，打印最长的子阅读。 这个
不支持fastq。
使用 onworks.net 服务在线使用 pls2fasta
