这是命令 reroot,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序:
您的姓名
reroot - 计算树的(新)根。
概要
重新root [配置] 树文件
商品描述
这个程序将树重新植根于在选定的边上。
默认是输出一个随机的rerooting,但是你也可以选择把边缘给
放根,或外群,甚至所有可能的生根。
除非选择了详尽的生根,否则输出将写入标准输出。 然后 -o 给出
要使用的文件名前缀并将结果写入_ .tree,哪里是
边头的节点号。
警告! 在当前实现中,所有时间/长度信息都丢失了。
配置
- 帮帮我 显示帮助
-V, - 版
打印版本并退出
-S, --从标准输入读取树
从 STDIN 读取树(没有)
-f, --输入格式 素数|输入xml
输入格式。 默认为素数
-e, --详尽无遗
做所有可能的生根
-o, --输出文件前缀 文件前缀
文件名的词干
-n, --节点索引 INT
在通往节点的边缘重新根植树
-g, --外群 STRING
包含以逗号分隔的叶子的最小子树的根树
参数
退出 状态
0 程序执行成功。
1 发生了一些错误
网址
prime-phylo 主页: http://prime.sbc.su.se
使用 onworks.net 服务在线使用 reroot