这是名为 Chemical Trajectory Analyzer 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 ChemTraYzer_2.1.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Chemical Trajectory Analyzer 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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化学轨迹分析仪
商品描述
ChemTraYzer 通过分子动力学模拟创建反应模型。 它可作为开放软件（MIT 许可）使用。 请找到完整的描述@ https://www.ltt.rwth-aachen.de/cms/LTT/Forschung/Forschung-am-LTT/Model-Based-Fuel-Design/Aktuelle-Projekte/~kqbf/ChemTraYzer/lidx/1
M.Döntgen、M.-D.Przybylski-Freund、LCKröger、WAKopp、AEIsmail、K.Leonhard，“使用反应分子动力学模拟自动发现反应途径、速率常数和过渡态”，J. Chem。 理论计算。 11 (2015), 2517-2524
LCKröger、WAKopp、M.Döntgen、K.Leonhard，“评估反应性分子动力学模拟中罕见事件的统计不确定性”，J. Chem。 理论计算。 13 (2017), 3955-3960
M.Döntgen、F.Schmalz、WAKopp、LCKröger、K.Leonhard，“通过混合反应分子动力学和量子化学模拟进行自动化化学动力学建模”，J. Chem。 信息。 模型。 58 (2018), 1343-1355
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项目特色
- LAMMPS/ReaxFF 轨迹模拟的处理
- 自动检测反应事件
- 速率常数的评估
- 生成反应网络以供后期可视化
目的
科学/研究，工程
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/chemtrayzer/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。