这是名为 FusionCatcher 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 fusioncatcher_v1.33.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 FusionCatcher 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
融合捕手
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商品描述
FusionCatcher 在来自患病样本的 RNA-seq 数据（来自 Illumina NGS 平台（如 Solexa 和 HiSeq）的配对末端读数）中搜索新的/已知的体细胞融合基因、易位和嵌合体。
FusionCatcher 的目标是：
- 寻找候选融合基因的检测率非常高，
- 非常易于使用（即运行 FusionCatcher 不需要数据库和生物信息学的先验知识），
- 非常好地检测具有挑战性的融合基因，例如 IGH 融合、CIC 融合、DUX4 融合、CRLF2 融合、TCF3 融合等。
- 尽可能自动化（即 FusionCatcher 将自动选择最佳参数以找到候选融合基因，例如自动寻找适配器，根据输入读数的长度自动构建外显子-外显子连接等）同时为寻找融合基因提供最佳的检测率。
目的
学术/科研
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。