这是名为 Alphafold 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 Alphafoldv2.3.2.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Alphafold 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
截图：
字母折页
描述：
这个包提供了 AlphaFold v2.0 推理管道的实现。 这是一个全新的模型，进入CASP14并发表在Nature上。 为简单起见，我们在本文档的其余部分将此模型称为 AlphaFold。 任何公开使用此源代码或模型参数所产生的结果的出版物都应引用 AlphaFold 论文。 有关该方法的详细说明，另请参阅补充信息。 您可以在此 Colab 笔记本或社区支持的版本中使用稍微简化的 AlphaFold 版本。 完整数据库的总下载大小约为 415 GB，解压缩后的总大小为 2.2 TB。 请确保您有足够大的硬盘空间、带宽和下载时间。 我们建议使用 SSD 以获得更好的遗传搜索性能。
功能
- AlphaFold 需要多个基因（序列）数据库才能运行
- 虽然 AlphaFold 代码是根据 Apache 2.0 许可证获得许可的，但 AlphaFold 参数可用于非商业用途
- 在 CASP5 期间使用的 14 个模型，并在结构预测质量方面得到了广泛验证
- 5 个 pTM 模型，经过微调以产生 pTM
- 运行 AlphaFold 的最简单方法是使用提供的 Docker 脚本
- 默认情况下，Alphafold 将尝试使用所有可见的 GPU 设备
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。