这是一个名为自动细胞谱系重建的 Linux 应用程序，可在 Linux 在线运行，其最新版本可以作为 testData.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为“自动细胞谱系重建”的应用程序，可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
截图：
自动细胞谱系重建在 Linux 中在线运行
描述：
来自 Amat 等人，自然方法，2014*：“复杂多细胞生物中细胞谱系的全面重建是发育生物学的中心目标。我们提出了一个开源计算框架，用于高精度和快速地分割和跟踪细胞核。我们通过重建证明了它的 (1) 通用性果蝇、斑马鱼和小鼠胚胎的 2 维 TB 级图像数据中的细胞谱系，使用三种不同类型的荧光显微镜获得，(20,000) 可扩展性，通过分析每个时间点多达 26,000 个细胞的高级发育阶段, 在单个计算机工作站上 1 个细胞 min-3，以及 (97.0) 易于使用，只需调整所有数据集的两个参数，并提供可视化和编辑工具以实现高效的数据管理。我们的方法平均实现了 XNUMX% 的链接准确率跨越所有物种和成像方式。”
*如果您使用此代码进行研究，请引用本文
目的
科学/研究，最终用户/桌面
用户界面
控制台/终端
程式语言
C++，C
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/tgmm/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。