这是名为 bspipe 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 bspipe-1.3.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 bspipe 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
管道
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商品描述
BSpipe 是一个从序列质量控制和映射到差异甲基化区域功能分析的综合管道:
(1) 测序质量评估,
(2) 顺序清洗,
(3)序列读取映射,
(4)甲基化定量,
(4) 基于甲基化谱的样品比较,
(5) DMRs(差异甲基化区域)的鉴定,
(6) DMRs的注释,
(7)差异甲基化基因的功能分析,
(8) 生成用于可视化的输入文件,以及
(9) 支持高级测序技术,如 TAB-seq、OxBS-seq、MAP-it 和 NOMe-seq。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Unix Shell、Perl、S/R
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/bspipe/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。