这是名为 Calis-p 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Calisp-2.1.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Calis-p 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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卡利斯普
商品描述
Calis-p(蛋白质组学中同位素的 CALgary 方法)是一个 java 应用程序,用于从蛋白质组数据集估计微生物群落中单个物种的同位素组成(例如 delta13C 或 delta15N)。 Calis-p 2.0 处理天然同位素丰度和来自标记实验的数据,例如稳定同位素探测 (SIP)。 它需要一个 mzIdent(或目标光谱匹配)和 mzML 文件作为输入,每个 mzML 文件需要大约 1 分钟,有 10 个线程,并且需要 <10 Gb 的 RAM。 它已经使用来自各种纳米液相色谱/Orbitrap 平台的数据进行了测试。 对于成功的 SIP,它非常敏感,但需要 13C 分数保持在 10% 以下。
产品优势
- delta13C 是根据标准元蛋白质组数据集估计的
- 高效可靠地获得微生物组样本中许多物种的 delta13C。
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/calis-p/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。