这是名为 CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment to run in Linux online 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 cushaw3-v3.0.3.tar.bz2。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment 的应用程序,可通过 OnWorks 免费在线运行在 Linux 中。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
CUSHAW3:在 Linux 上在线运行的准确短读对齐
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商品描述
CUSHAW3 是一种开源并行化、灵敏且准确的短读对准器。 该比对器提出了一种通用方法,可将易读和硬读与大基因组(如人类基因组)正确对齐。 对对齐质量实数进行评估,CUSHAW3 在单端和双端对齐方面始终优于 CUSHAW2、BWA-MEM、Bowtie2 和 GEM。 此外,对于具有高错误率的短读取,我们的对齐器已经证明了比 Novalign3 更好的双端对齐性能。用户界面
控制台/终端
程式语言
C + +中
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/cushaw3/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。