这是一款名为 Drug Extraction 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 DrugExtractionStandalone.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 Drug Extraction 的应用程序,可在 Linux 中免费使用 OnWorks 在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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在 Linux 上在线运行的药物提取
商品描述
药物名称识别和规范化/基于 DrugBank id 和标准名称。软件包提供 2 个标签:
1. DrugTagger - 基于 CRF 的 DrugBank 存在特性(详见特性集)。
2. DrugnameGazetteer - 基于地名录/字典。 从 DrugBank.ca 数据库创建的字典。
两个标签都包括对 DrugBank id 和标准名称的接地/规范化。
功能集:
Word、Word-1、Word+1、Word-1_Word、Word_Word+1、DrugBankPresence、POS
DrugBankPresence 功能指示药物名称在 DrugBank 中的存在。
使用 CONLL 评估:
处理了 32065 个词条和 3656 个词组; 找到:3251 个词组; 正确:2786。
准确率:95.25%; 精度:85.70%; 召回率:76.20%; FB1:80.67
使用 GATE 语料库基准:
严格:P:0.65 R:0.73 F1:0.69
宽松:P:0.74 R:0.84 F1:0.78
如何复现评估的详细信息,请参阅 README。
要使用独立版本进行标记,请从文件下载 DrugExtractionStandalone.tar.gz。
用户界面
控制台/终端
程式语言
爪哇岛
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/drug-extraction/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。