这是名为 GENIE (GENe-geNe IntEraction) 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 GENIE_src.tar 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 GENIE (GEne-geNe IntEraction) 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
GENIE(基因-基因相互作用)
Ad
商品描述
当涉及大量 SNP 时,遗传关联研究中的基因-基因相互作用是计算密集型的。 大多数最新的中央处理单元 (CPU) 都有多个内核,而图形处理单元 (GPU) 也有数百个内核,并且最近已被用于实现更快的科学软件。 但是,目前还没有遗传分析软件包可以让用户充分利用这些多核设备的计算能力进行二元性状的遗传相互作用分析。
在这里,我们展示了一个新颖的软件包 GENIE,它利用多个 GPU 或 CPU 处理器内核的能力来并行化交互分析。
引文:Chikkagoudar, S.、Wang, K. 和 Li, M. (2011)。 GENIE:使用多个 GPU 或 CPU 内核进行基因关联研究中基因-基因相互作用分析的软件包。 BMC 研究笔记,4(1),158。
目的
学术/科研
程式语言
C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gpugenie/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。