这是名为 Grinder 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 Grinder-0.5.4.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这款名为 Grinder with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
磨床
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商品描述
Grinder 是一种多功能开源生物信息学工具,可为所有主要测序平台创建模拟组学鸟枪和扩增子序列库。
产品优势
- 霰弹枪或扩增子(例如 16S rRNA)读取文库
- 组学支持生成基因组、转录组、蛋白质组、宏基因组、宏转录组或宏蛋白质组数据集
- 任意读取长度分布和读取次数
- 模拟 PCR 和测序错误(嵌合体、点突变、均聚物)
- 支持双端(配对)数据集
- 每个基因组、基因或蛋白质的特定等级丰度设置或手动给定丰度
- 创建具有给定丰富度(alpha 多样性)的数据集
- 相关数据集可以共享可变数量的基因组(beta 多样性)
- 对由不同基因组长度或基因拷贝数产生的偏差进行建模
- 存储首选选项的配置文件机制
- 生物学家或高级用户可通过多个界面访问:GUI、CLI 和 API
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端
程式语言
Perl的
分类
生物信息学
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/biogrinder/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。