这是名为 High-Throughput Tabular Data Processor 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 htdpinstaller.exe。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 High-Throughput Tabular Data Processor with OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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高吞吐量表格数据处理器
商品描述
高通量表格数据处理器 (HTDP) 是 Java 应用程序,旨在促进由高通量技术(例如大规模并行测序或微阵列)产生的大型文本文件中的数据探索和缩减任务。 该软件已针对微阵列和深度平行测序数据进行了优化,但它可以接受任何字符分隔的表格数据集。 HTDP 还可以导入、处理和转换 Variant Call Format (VCF) 文件。 4.0、4.1 和 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP 提供快速过滤功能,可以处理由单个或多个输入文件组成的数据。
引用: Madanecki P、Bałut M、Buckley PG、Ochocka JR、Bartoszewski R、Crossman DK 等。 (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – 用于处理大型数据集的平台独立图形工具。 公共科学图书馆一 13(2):e0192858。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
项目特色
- 适用于任何以字符分隔的列数据(例如 BED、GFF、GTF、WIG、VCF)
- 垂直和水平合并表格数据文件
- 使用基因组位置或公共列合并任何表格数据文件
- 无限过滤和数据缩减功能
- 可以同时分析关于格式和内容的不同文件
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/htdp/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。