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适用于 Linux 的高吞吐量表格数据处理器下载

免费下载 High-Throughput Tabular Data Processor Linux 应用程序以在 Ubuntu online、Fedora online 或 Debian online 中在线运行

这是名为 High-Throughput Tabular Data Processor 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 htdpinstaller.exe。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

免费下载并在线运行这个名为 High-Throughput Tabular Data Processor with OnWorks 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

SCREENSHOTS

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高吞吐量表格数据处理器


商品描述

高通量表格数据处理器 (HTDP) 是 Java 应用程序,旨在促进由高通量技术(例如大规模并行测序或微阵列)产生的大型文本文件中的数据探索和缩减任务。 该软件已针对微阵列和深度平行测序数据进行了优化,但它可以接受任何字符分隔的表格数据集。 HTDP 还可以导入、处理和转换 Variant Call Format (VCF) 文件。 4.0、4.1 和 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP 提供快速过滤功能,可以处理由单个或多个输入文件组成的数据。

引用: Madanecki P、Bałut M、Buckley PG、Ochocka JR、Bartoszewski R、Crossman DK 等。 (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – 用于处理大型数据集的平台独立图形工具。 公共科学图书馆一 13(2):e0192858。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858



项目特色

  • 适用于任何以字符分隔的列数据(例如 BED、GFF、GTF、WIG、VCF)
  • 垂直和水平合并表格数据文件
  • 使用基因组位置或公共列合并任何表格数据文件
  • 无限过滤和数据缩减功能
  • 可以同时分析关于格式和内容的不同文件


程式语言

爪哇岛


分类

科学/工程、生物信息学

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/htdp/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。


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