这是名为 HSRA 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 HSRA-v1.1.tar.gz 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行名为 HSRA 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
HSRA
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商品描述
HSRA 是一种基于 MapReduce 的并行工具，用于映射来自 RNA 测序 (RNA-seq) 实验的读数。 RNA-seq 分析通常首先将读数映射到参考基因组，以确定读数的来源位置，这是一个非常耗时的步骤。 该工具允许生物信息学研究人员通过将快速多线程拼接对齐器 (HISAT2) 与 Apache Hadoop（用于可扩展大数据处理的分布式计算框架）相结合，有效地在集群节点上分配他们的映射任务。
HSRA 目前支持来自 FASTQ/FASTA 数据集的单端和双端读取比对。 此外，我们的工具使用 Hadoop 序列解析器 (HSP) 库（上面的链接）来有效读取存储在 Hadoop 分布式文件系统 (HDFS) 上的输入数据集，能够处理使用 Gzip 和 BZip2 编解码器压缩的数据集。
目的
信息技术、医疗保健行业、科学/研究
用户界面
控制台/终端，命令行
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/hsra/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
