这是名为 Meraculous-2D 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Meraculous-v2.2.6.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Meraculous-2D 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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奇迹二维
商品描述
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重要提示:Meraculous-2D 已被 HipMer 汇编器取代,可在此处获得: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
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Meraculous-2D 是用于 NGS 读数 (Illumina) 的全基因组组装器,能够以适度的计算要求组装大型二倍体基因组。 功能包括:
- 高效的 k-mer 计数和 deBruijn 图遍历
- 处理二倍体等位基因变异的两种模式
- 改进的脚手架,可在不影响脚手架精度的情况下生产更完整的组件。
该程序集由 perl 管道驱动,该管道执行数据分片和负载平衡,以及在 GE/SLURM 类型集群或独立多核服务器上提交和监控多个任务阵列。
提交的手稿:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608
产品优势
- 真核基因组组装
- 高和低杂合性基因组组装的专业模式
- 内置分布式执行
- 高效的k-mer空间操作
- 单服务器和集群就绪部署(AWS 就绪)
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
语言,C++
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/meraculous20/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。