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适用于 Linux 的 Meraculous-2D 下载

免费下载 Meraculous-2D Linux 应用程序以在 Ubuntu 在线、Fedora 在线或 Debian 在线中在线运行

这是名为 Meraculous-2D 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Meraculous-v2.2.6.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Meraculous-2D 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

SCREENSHOTS

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奇迹二维


商品描述

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重要提示:Meraculous-2D 已被 HipMer 汇编器取代,可在此处获得: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
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Meraculous-2D 是用于 NGS 读数 (Illumina) 的全基因组组装器,能够以适度的计算要求组装大型二倍体基因组。 功能包括:

- 高效的 k-mer 计数和 deBruijn 图遍历
- 处理二倍体等位基因变异的两种模式
- 改进的脚手架,可在不影响脚手架精度的情况下生产更完整的组件。

该程序集由 perl 管道驱动,该管道执行数据分片和负载平衡,以及在 GE/SLURM 类型集群或独立多核服务器上提交和监控多个任务阵列。

提交的手稿:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608



产品优势

  • 真核基因组组装
  • 高和低杂合性基因组组装的专业模式
  • 内置分布式执行
  • 高效的k-mer空间操作
  • 单服务器和集群就绪部署(AWS 就绪)


目的

学术/科研


用户界面

命令行


程式语言

语言,C++


分类

生物信息学

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/meraculous20/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。


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