这是名为 metawatt 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可作为 MetaWatt-3.5.3.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 metawatt 的应用程序,可免费使用 OnWorks 在 Linux 中在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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metawatt 在 Linux 上在线运行
商品描述
Metawatt 分箱是一种图形分箱工具,它利用四核苷酸频率的多变量统计数据和基于差异覆盖的分箱。 它还执行分级质量的分类评估(通过钻石 BLASTx)。 创建的 bin 可以编辑并导出为 fasta。 Metawatt 是在 Java SWING 中实现的,并且最低限度地依赖于 Diamond、HMMer3.1、BBMap、Prodigal 和用于导出 SVG 图形的 Batik 库。引文:Strous M、Kraft B、Bisdorf R、TegetMeyer H (2012) 混合培养微生物生理学宏基因组重叠群的分箱。 微生物生理学和代谢前沿 3:410。 doi:10.3389/fmicb.2012.00410
产品优势
- 宏基因组重叠群的组合四核苷酸和差异覆盖分箱
- 用于数据探索的图形用户界面
- 使用 Diamondblastp 对垃圾箱进行分类分析
- 保守单拷贝基因的检测
- 基于保守基因的 bins 系统发育树
- 交互式 GC/覆盖率或覆盖率/覆盖率图
- 还可以在命令行上完全自动运行
目的
学术/科研
用户界面
Java秋千
程式语言
爪哇岛
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/metawatt/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。