这是名为 Molecular Dynamics Studio 的 Linux 应用程序，其最新版本可作为 WindowsRelease.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Molecular Dynamics Studio 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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分子动力学工作室
商品描述
这是为集成 NanoEngineer-1、PACKMOL 和 MSI2LMP 而创建的软件修改集合，旨在轻松创建分子动力学单元。 NanoEngineer-1 是由 Nanorex 编写的分子 CAD 软件，为用户提供了一种创建分子的简单方法，而软件修改允许用户使用多个力场键入原子。 PACKMOL 可以使用 NanoEngineer-1 的分子模板生成分子的随机集合，从而提供初始 MD 单元。 对 PACKMOL 的修改允许将原子类型数据传递到 MSI2LMP 软件。 MSI2LMP 基于 I 类或 II 类力场创建 LAMMPS 输入文件。 MSI2LMP 被修改为使用由 NanoEngineer-1 生成的数字编码力场数据。 MMP 文件格式已扩展并集成到所有三个软件应用程序中。
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
项目特色
- 通过 NanoEngineer-1 的分子 CAD 功能
- 根据 CFF91 原子力场手动键入原子
- 使用 NanoEngineer-1 创建分子模板
- 使用 PACKMOL 和多分子模板生成 MD 单元
- 使用 MSI2LMP 生成 LAMMPS 几何输入文件
目的
学术/科研
用户界面
OpenGL、Qt
程式语言
Fortran、Python、C++、C
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
