这是名为 primeScaff 的 Linux 应用程序，其最新版本可以作为 primeScaff-v1.6.1_linux_x86_64.tar.gz 下载。它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并使用 OnWorks 在线运行名为 primeScaff 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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PrimeScaff
商品描述
primeScaff 旨在自动化有时繁琐的过程，手动设计围绕基因组支架间隙的特定引物对，并加速基因组测序项目的基因组完成阶段。 它结合了使用 RECON 从头重复发现的功能，以避免尽可能多地在重复区域设计引物，并提供使用引物 3 轻松微调引物设计选项的可能性。 它输出 gff2 和 gff3 中的重复、间隙和引物注释，以便使用 UGENE（推荐）或 artemis 等工具轻松加载和可视化结果。
产品优势
- 使用迭代 RECON 进行迭代从头重复掩蔽
- 在几秒钟内自动设计支架中数百个间隙的引物
- 可用于任何装配流水线，只需要一个标准的 FASTA 文件
- 没有密切参考的从头组装项目的解决方案
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
Perl的
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/primescaff/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
