这是名为 PRIMUS 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 URLtoLastestPRIMUSversion.txt 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 PRIMUS 的应用程序,可在 Linux 中免费使用 OnWorks 在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
PRIMUS 在 Linux 上在线运行
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商品描述
新:在 primus.gs.washington.edu 下载带有谱系重建的新版本此版本已过时且不完整。 请访问新网站以获取 PRIMUS 的完整版本。
我们提出了一种改编自图论的方法,该方法始终识别任何数据集中无关个体的最大集合,并允许在无关样本选择中使用加权参数。 PRIMUS 读取用户生成的 IBD 估计值,并在给定指定的相关性阈值的情况下输出最大可能的无关个体集。 还可利用用于优先选择个体的附加信息。 例如,当网络中有两个大小相同的最大无关个体集时,PRIMUS 可以优先选择受影响个体较多的集合。
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相关软件:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
項目特色
- 从遗传数据集中识别最大的不相关个体集
- 将样本分组为家庭网络
- 生成 .dot 文件以可视化家庭网络
目的
医疗保健行业、科学/研究、教育
程式语言
Perl的
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/primus-beta/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。