这是名为 PyPedal 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 PyPedal-2.0.3.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 PyPedal 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
SCREENSHOTS
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踏板
商品描述
PyPedal 是一个 Python 模块，它提供了用于操作系谱、简单可视化系谱以及计算系谱遗传多样性度量的工具。
項目特色
- 以用户定义的格式读取系谱文件
- 检查系谱完整性（重复 ID、比后代年轻的父母等）
- 生成谱系文件中出现频率等汇总信息
- 谱系文件的重新排序和重新编号
- 使用表格方法从谱系文件计算分子关系矩阵 (A)
- 大谱系的近交计算
- 近亲繁殖和亲缘关系的平均总和平均个体系数的计算
- 使用迭代表格方法计算部分近亲繁殖系数（Lacy，1996 年；Gulisija，2006 年）
- 使用 Ballou (1997) 或 Suwanlee 等人的方法计算祖先近亲繁殖系数。 (2007)
- 计算理论和实际有效人口规模
- 使用 Lacy 精确算法计算有效创始人编号
- 使用 Boichard 等人的近似算法计算有效创始人数量。
- 使用 Boichard 等人的算法计算有效祖先数。
- 选择包含动物所有祖先的子系
- 鉴定两种动物的共同亲属
- 从预期交配计算后代的近亲繁殖
- 输出到 ASCII 文本文件，包括矩阵、近亲繁殖和关系系数以及摘要信息
- GEDCOM 5.5 文件的导入和导出
- 导入和导出 GENES 1.20 (dBase III) 文件
- 从 MySQL、Postgres 和 SQLite 数据库加载谱系并将其保存到
- 使用源自 Matvec 1.1a 的算法模拟系谱
目的
教育、科学/研究
用户界面
命令行
程式语言
Python
数据库环境
MySQL、PostgreSQL (pgsql)、SQLite
分类
信息分析、数学
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pypedal/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
