这是名为 raxmlGUI 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 raxmlGUI1.5b3.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 raxmlGUI 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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图形界面
商品描述
发布说明:在新项目位置获取 raxmlGUI 2.0: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/raxmlGUI 是 RAxML 的图形用户界面,RAxML 是使用最大似然进行系统发育推断的最流行和最广泛使用的软件之一。
使用 RAxML 进行系统发育分析的用户友好图形前端(Stamatakis,2006)。 请引用:Silvestro, Michalak (2012) - raxmlGUI:RAxML 的图形前端。 生物多样性和进化 12, 335-337。 DOI:10.1007/s13127-011-0056-0
产品优势
- *新版本 2.0 现已推出: https://antonellilab.github.io/raxmlGUI/*
- *版本 1.5* 增加了通过 CIPRES Science Gateway 运行分析的可能性
- GUI 包括 RAxML 可执行文件
- 多平台兼容性(Mac OS、Windows、Linux)
- 需要 Python 2.6、2.7
- 用于数据分区和外群选择的直观界面
- DNA、氨基酸、二元和多态比对的模型选择
- 自动将 NEXUS 转换为 PHYLIP(反之亦然)
- 导入 FASTA 文件
- 祖境重建
- “启动”功能(Pattengale 等人,2010 年)
- 交互式站点排除
- 将多个对齐方式与自动分区相结合
- 拓扑约束的交互式定义
- Robinson-Foulds 成对距离
- 每个站点的可能性
目的
学术/科研
用户界面
Tk
程式语言
Python
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/raxmlgui/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。