这是一个名为 VCF Explorer 的 Linux 应用程序,可在 Linux 在线运行,其最新版本可以作为 VCFExplorer.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 VCF Explorer 的应用程序,可在 Linux 中免费使用 OnWorks 在线运行。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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VCF Explorer 在 Linux 上在线运行
商品描述
降低成本的高通量技术催生了许多由数千个全基因组组成的测序项目。 从外显子组到全基因组的范式转变带来了输出文件大小的显着增加。 大多数用于分析外显子组文件的现有工具都不适用于全基因组研究产生的大型 VCF 文件。 在这项工作中,我们展示了 VCF-Explorer,一种能够处理大文件的变体分析软件。 程序的高效内存管理和初步解析步骤的消除使得可以在普通计算机上进行分析。 VCF-Explorer 提供了一个易于使用的环境,可以在其中定义注释和样本的各种类型的查询。 VCF-Explorer 可以在从标准笔记本电脑到高级服务器的不同环境和计算平台上运行。产品优势
- 易于使用的环境
- 高效的内存管理
- 大型(全基因组)VCF 文件处理
- 可在计算资源有限的个人计算机上运行
用户界面
Qt
程式语言
C++,C
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。