这是名为 Gen3D 的 Windows 应用程序，其最新版本可以下载为 gen3d.cpp。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Gen3D 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
Ad
Gen3D
商品描述
Gen3D 是一个旨在确定三维基因组和染色体模型的应用程序。 它使用染色体接触数据来构建三维构象。 该方法可以生成满足大部分染色体接触的三维染色体模型。
该软件由美国密苏里大学哥伦比亚分校计算机科学系程健林教授的生物信息学、数据挖掘和机器学习实验室开发。 该项目得到了美国国家科学基金会的支持（资助号：DBI1149224）。
如果您在研究中使用 Gen3D，请引用：
Nowotny、Jackson、Sharif Ahmed、Lingfei Xu、Oluwatosin Oluwadare、Hannah Chen、Noelan Hensley、Tuan Trieu、Renzhi Cao和Jianlin Cheng。 “从染色体接触数据迭代重建人类染色体的三维模型。” BMC 生物信息学 16，没有。 1 (2015): 338。
产品优势
- 使用通过 Hi-C 技术获得的染色体接触数据
- 从染色体接触数据构建 3D 结构基因组和染色体模型
- 使用概率方法初始化坐标
- 在热图矩阵中表示满意接触的新方法
- 计算远距离和近距离接触的计分方案
- 与其他现有方法相比，也通过基因组特征进行了验证
目的
科学/研究，工程
程式语言
C + +中
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gen3d/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
