这是名为nichenetr 的Windows 应用程序，其最新版本可以作为v2.0.4.zip 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行名为nichenetr 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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利基网络
商品描述
nichenetr：NicheNet 方法的 R 实现。 NicheNet 的目标是从计算角度研究细胞间通信。 NicheNet 使用人类或小鼠相互作用细胞的基因表达数据作为输入，并将其与先前的模型相结合，该模型整合了配体到靶标信号通路的现有知识。 这允许预测可能驱动感兴趣细胞中基因表达变化的配体-受体相互作用。 然后，可以使用有关潜在配体-靶标链接的先验信息模型来推断相互作用的细胞之间的活跃配体-靶标链接。 NicheNet 根据配体的活性（即它们对接收细胞中观察到的基因表达变化的预测程度）对配体进行优先级排序，并寻找受这些优先配体调节的高潜力的受影响靶标。
項目特色
- NicheNet 与当前研究细胞间通信的大多数计算方法有很大不同
- 评估发送细胞表达的配体如何预测接收细胞中基因表达的变化，根据配体对基因表达的影响优先考虑配体
- 推断所研究系统中活跃的假定配体-靶标连接
- 验证先前的配体-靶标模型
- 用户定义的先验配体靶标模型的构建
- 我们提供有关如何对主要预测进行直观可视化的说明
程式语言
R
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/nichenetr.mirror/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
