这是名为 P3BSseq 的 Windows 应用程序,可通过 Linux 在线在 Windows 上运行,其最新版本可以下载为 P3BSseq_v2.1.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 P3BSseq 的应用程序,以免费在 Windows 上通过 Linux 在线运行 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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P3BSseq 在 Windows 上在线运行于 Linux 在线
商品描述
亚硫酸氢盐测序 (BSseq) 处理是最繁琐的下一代测序 (NGS) 应用之一。 尽管有一些 BSseq 处理工具可用,但它们是分散的,需要令人费解的参数,并且对运行时间和内存使用率要求很高。 我们开发了 P3BSseq,这是一种并行处理管道,用于快速、准确和自动分析 BSseq 读数,可修剪、对齐、注释、记录中间结果,执行亚硫酸氢盐转化质量评估,生成 BED 甲基化组和遵循 NIH 标准的报告文件。 P3BSseq 在运行时间、计算机硬件要求方面优于已知的 BSseq 映射器。 我们优化了定向和非定向库的 P3BSseq 参数,以及全基因组和减少表示 BSseq 的单端和双端读取。 P3BSseq 是一个用户友好的 BSseq 上游分析的简化解决方案,只需要基本的计算机和 NGS 知识。产品优势
- 下一代测序 (NGS) 数据处理
- DNA甲基组学分析
- 并行处理
- 亚硫酸氢盐测序 (RRBS) 的代表性降低
目的
学术/科研
用户界面
控制台/终端
程式语言
Python
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。