这是名为 sgRNAcas9 的 Windows 应用程序,其最新版本可以作为 sgRNAcas9_3.0.5.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 sgRNAcas9 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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sgRNAcas9
商品描述
该软件包包括使用用户定义的参数搜索 CRISPR 目标位点(原型间隔区)、预测全基因组 Cas9 潜在脱靶切割位点 (POT)、将 POT 分为三类、批量设计寡核苷酸以构建 20 -nt(核苷酸)或截断的 sgRNA 表达载体,提取所需长度的核苷酸序列,位于目标或脱靶切割位点两侧,用于设计 PCR 引物对,以通过 T7E1 切割测定验证突变。 重要的是,通过在计算机中识别潜在的脱靶位点,sgRNAcas9 允许选择更具体的目标位点并帮助识别真正的脱靶位点,显着促进用于基因组编辑应用的 sgRNA 设计。引用:Xie S、ShenB、Zhang C、Huang X、Zhang Y。sgRNAcas9:用于设计 CRISPR sgRNA 和评估潜在脱靶切割位点的软件包。 公共科学图书馆一。 2014,9(6):e100448。
http://www.biootools.com/
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。