这是名为 Tax4Fun2 的 Windows 应用程序,其最新版本可以下载为 Tax4Fun2_1.1.3.tar.gz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Tax4Fun2 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
税4Fun2
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商品描述
Tax4Fun2 是不断发展中的,将取代旧的 Tax4Fun (http://tax4fun.gobics.de/).新版本基于 275 个古细菌和 12102 个细菌基因组(RefSeq 中的完整或染色体状态)。 我没有包括 MAG 或非常不完整的基因组,但 Tax4Fun2 的重要特征之一是它能够合并用户数据(支持原核生物和真核生物)。 此外,我们添加了一个功能来计算(多)功能冗余指数。 我添加了一个示例,如何预测功能配置文件和功能冗余。 欲知更多详情: https://www.biorxiv.org/content/early/2018/12/09/490037 (请注意,这是预印本,还没有同行评审)。
您需要先在系统上安装 NCBI BLAST+,然后才能使用它。 对于某些功能,您需要安装 R 包 ape 和 seqinr。
我你有任何问题或疑问,请联系我([电子邮件保护]).
項目特色
- 16S rRNA 数据的功能预测
- 功能冗余
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/tax4fun2/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。