这是名为 VarScan 的 Windows 应用程序,其最新版本可以作为 VarScan.v2.3.9.jar 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为 VarScan with OnWorks 的应用程序是免费的。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
截图:
无功扫描
描述:
大规模并行测序中的变异检测。 对于一个样本,称为 SNP、插入缺失和共有基因型。 对于肿瘤-正常对,进一步将每个变异分类为种系、体细胞或 LOH,并检测体细胞拷贝数变化。 最新版本可在 GITHUB 上获得
产品优势
- 从 SAMtools 堆积文件调用 SNP 和插入缺失
- 按覆盖范围、读取深度、变异频率和碱基质量过滤变异
- 确定肿瘤-正常对的体细胞状态(体细胞、种系、LOH)
- 比较、合并和交叉两个变体列表
- 将变体调用限制为一组目标位置或目标区域
- 免费用于非商业用途。
目的
学术/科研
用户界面
命令行
程式语言
爪哇岛
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/varscan/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。