এটি সেই কমান্ড সরাইটার যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
sawriter - নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সের জন্য প্রত্যয় অ্যারে তৈরি করুন
সাইনোপিসিস
লেখক saout fastaIn [fastaIn2 fastaIn3 ...] [-বিএলটি p] [-4 বিট]
[-লারসন|-মানুষ|-কার|-মাফে|-ওয়েল্টার]
লেখক fastaIn (fastaIn.sa কে লিখেছেন)
বিকল্প
-বিএলটি p দৈর্ঘ্যের উপসর্গের উপর একটি লুকআপ টেবিল তৈরি করুন p. এটি লুকআপগুলিকে যথেষ্ট গতিশীল করে
(LCP টেবিলের চেয়ে বেশি), কিন্তু এর চেয়ে কম ম্যাচ মিস করে p অনুসন্ধান করার সময়।
-4 বিট একটি সংকুচিত সিকোয়েন্স ফাইল হিসাবে (এক) ফাস্টা ফাইলে পড়ুন।
পদ্ধতি
-লারসন (ডিফল্ট) অ্যারে তৈরি করতে লারসন এবং সাদাকানের পদ্ধতি ব্যবহার করে।
-মা অ্যারে তৈরি করতে MANber এবং MYers এর পদ্ধতি ব্যবহার করে (লার্সনের চেয়ে ধীর,
এবং একই ফলাফল তৈরি করে। এটি মূলত ডবল চেক করার জন্য
লার্সনের সঠিকতা)।
-কার্ক প্রত্যয় অ্যারে নির্মাণের জন্য Karkkainen DS3 পদ্ধতি ব্যবহার করুন। এই সম্ভবত হবে
লার্সনের চেয়ে ধীর হতে, কিন্তু শুধুমাত্র একটি অতিরিক্ত N/(sqrt 3) অতিরিক্ত স্থান নেয়।
-মাফে (আপাতত নিষ্ক্রিয়!) মানজিনি থেকে লাইটওয়েট নির্মাণ অ্যালগরিদম ব্যবহার করুন
এবং ফেরাগিনা
-ওয়েল্টার
লাইটওয়েট (আলোর সাজানোর) প্রত্যয় অ্যারে নির্মাণ ব্যবহার করুন। এই একটু
স্বাভাবিক লার্সনের চেয়ে বেশি ধীর।
-ওয়েলটারওয়েট N
আকারের একটি পার্থক্য কভার ব্যবহার করুন N প্রত্যয় অ্যারে নির্মাণের জন্য। বৈধ মান হয়
7,32,64,111, এবং 2281।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে sawriter ব্যবহার করুন
