āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻāĻĢā§āĻ¯āĻžāĻ āĻ¯āĻž āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻĢā§āĻĄā§āĻ°āĻž āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻā§āĻ°āĻŽ:
NAME āĻāĻ°
āĻāĻĢā§āĻ¯āĻžāĻ - āĻāĻĒāĻšā§āĻ¯āĻžāĻ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻā§āĻāĻ°ā§ āĻāĻ°ā§
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
tophat: TopHat āĻĒā§āĻ°ā§ āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻŽ āĻĨā§āĻā§ āĻŦāĻŋāĻ¯āĻŧā§ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻāĻ¨ āĻĨā§āĻā§ āĻ¸āĻāĻā§āĻˇāĻŋāĻĒā§āĻ¤ āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ° āĻ¤ā§āĻ°ā§ āĻāĻ°ā§āĨ¤
āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ°:
āĻā§āĻĢāĻžāĻ [āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ] [āĻĒāĻĄāĻŧāĻž 1[,āĻĒāĻĄāĻŧāĻž 2,...]] \
[quals1, [quals2,...]] [quals1[,quals2,...]]
āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
-v/--āĻ¸āĻāĻ¸ā§āĻāĻ°āĻŖ
-o/-āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ-āĻĄāĻŋāĻ°
[ āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: ./tophat_out ]
-- bowtie1
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: bowtie2 ]
-N/-āĻĒāĻĄāĻŧāĻž-āĻ āĻŽāĻŋāĻ˛
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĒāĻ āĻ¨-āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻ§āĻžāĻ¨-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĒāĻĄāĻŧā§āĻ¨-āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻžāĻĻāĻ¨āĻž-āĻā§āĻ˛āĻž
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĒāĻĄāĻŧāĻž-āĻĒā§āĻ¨āĻ°āĻžāĻ¯āĻŧ-āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻžāĻĻāĻ¨āĻž-āĻĄāĻŋāĻ¸ā§āĻ
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: "āĻ°āĻŋāĻĄ-āĻāĻĄāĻŋāĻ-āĻĄāĻŋāĻ¸ā§āĻ" + 1 ]
-a/-āĻŽāĻŋāĻ¨-āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻāĻ°
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 8]
-m/--- splice-āĻ āĻŽāĻŋāĻ˛
<0-2> [ āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 0 ]
-i/-āĻŽāĻŋāĻ¨-āĻāĻ¨āĻā§āĻ°āĻ¨-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 50]
-I/-āĻ¸āĻ°ā§āĻŦā§āĻā§āĻ-āĻāĻ¨ā§āĻā§āĻ°ā§āĻ¨-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 500000]
-g/---āĻ¸āĻ°ā§āĻŦā§āĻā§āĻ-āĻŽāĻžāĻ˛ā§āĻāĻŋāĻšāĻŋāĻ
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 20]
--āĻĻāĻŽāĻ¨-āĻšāĻŋāĻ
-x/-āĻā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¸āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻā§āĻŽ-āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻ¸-āĻšāĻŋāĻ
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 60]
-M/-āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻĢāĻŋāĻ˛ā§āĻāĻžāĻ°-āĻŽāĻžāĻ˛ā§āĻāĻŋāĻšāĻŋāĻ
(āĻāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ -G/--GTF āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ, āĻāĻŋāĻ¨ā§āĻŽā§āĻ° āĻŦāĻŋāĻ°ā§āĻĻā§āĻ§ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻĨāĻŽāĻŋāĻ āĻŦāĻžāĻāĻāĻŋ āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ¨ā§āĻ§āĻžāĻ¨ āĻ¸āĻā§āĻˇāĻŽ āĻāĻ°ā§āĻ¨)
--āĻ¸āĻ°ā§āĻŦā§āĻā§āĻ-āĻ¸āĻ¨ā§āĻ¨āĻŋāĻŦā§āĻļ-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 3]
--āĻ¸āĻ°ā§āĻŦā§āĻā§āĻ-āĻŽā§āĻāĻž-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 3]
--āĻ¸ā§āĻ˛ā§āĻā§āĻ¸āĻž-āĻā§āĻŖ
--āĻ¸ā§āĻ˛ā§āĻā§āĻ¸āĻžā§§.3-āĻā§āĻŖ
(phred64-quals āĻšāĻŋāĻ¸āĻžāĻŦā§ āĻāĻāĻ)
--phred64-āĻā§āĻŖ
(solexa1.3-quals āĻāĻ° āĻŽāĻ¤ā§)
-Q/--āĻā§āĻŖ
--āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖāĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž-āĻā§āĻŖ
-C/---āĻ°āĻ
(āĻāĻ āĻŋāĻ¨ - āĻ°āĻā§āĻ° āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨)
--āĻ°āĻ-āĻāĻāĻ
--āĻ˛āĻžāĻāĻŦā§āĻ°ā§āĻ°āĻŋ-āĻāĻžāĻāĻĒ
(fr-unstranded, fr-firststrand, fr-secondstrand)
-p/-āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž-āĻĨā§āĻ°ā§āĻĄ
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 1]
-R/--āĻā§āĻŦāĻ¨āĻŦā§āĻ¤ā§āĻ¤āĻžāĻ¨ā§āĻ¤
(āĻ¸āĻŽā§āĻĒāĻžāĻĻāĻ¨āĻž āĻĒā§āĻ¨āĻ°āĻžāĻ¯āĻŧ āĻļā§āĻ°ā§ āĻāĻ°āĻžāĻ° āĻā§āĻˇā§āĻāĻž āĻāĻ°ā§āĻ¨)
-G/---āĻāĻŋāĻāĻŋāĻāĻĢ
(āĻāĻžāĻ¨āĻž āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒāĻŋ āĻ¸āĻš GTF/GFF)
--āĻā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¸āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻā§āĻŽ-āĻ¸ā§āĻāĻ
(āĻā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¸āĻā§āĻ°āĻŋāĻĒā§āĻā§āĻŽ āĻŦā§āĻāĻŋ āĻ¸ā§āĻāĻ)
-T/-āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒāĻŋ
(āĻļā§āĻ§ā§āĻŽāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ˛āĻŋāĻĒāĻŋāĻ¤ā§ āĻŽāĻžāĻ¨āĻāĻŋāĻ¤ā§āĻ°)
-j/---āĻāĻžāĻāĻāĻž-āĻāĻā§āĻāĻ¸
-- āĻ¸āĻ¨ā§āĻ¨āĻŋāĻŦā§āĻļ
--āĻŽā§āĻā§ āĻĢā§āĻ˛āĻž
-r/---āĻ¸āĻžāĻĨā§-āĻ āĻā§āĻ¯āĻ¨ā§āĻ¤āĻ°ā§āĻŖ-āĻā§āĻ˛āĻž
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 50]
--mate-std-dev
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 20]
--āĻ¨ā§-āĻāĻĒāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸-āĻāĻā§āĻāĻ¸
--āĻ¨ā§-āĻāĻĒāĻ¨ā§āĻ¯āĻžāĻ¸-āĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ˛
--no-gtf-juncs
--āĻ¨ā§-āĻāĻāĻžāĻ°ā§āĻ-āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ¨ā§āĻ§āĻžāĻ¨
--āĻāĻāĻžāĻ°ā§āĻ-āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ¨ā§āĻ§āĻžāĻ¨
--āĻŽāĻžāĻāĻā§āĻ°ā§āĻāĻā§āĻ¸āĻ¨-āĻ¸āĻžāĻ°ā§āĻ
--āĻāĻŋāĻĒ-āĻāĻŋāĻāĻŽāĻĒāĻŋ
--tmp-dir
[ āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ:/ tmp -āĻ° āĻĒāĻ°āĻŋāĻŦāĻ°ā§āĻ¤ā§ ]
-z/---āĻā§āĻĄāĻĒā§āĻ¯āĻžāĻāĻžāĻ°
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: gzip]
-X/-āĻāĻ¨āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻĄ-āĻĢāĻŋāĻĢā§
[āĻ°āĻā§āĻ° āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨ āĻĒāĻĄāĻŧāĻžāĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻ°āĻ āĻ āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¯āĻŧā§ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ¸āĻāĻā§āĻāĻŋāĻ¤ āĻāĻ°āĻ¤ā§ mkfifo āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨]
āĻ āĻā§āĻ°āĻ¸āĻ° āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ:
--āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻŦā§āĻĻāĻ¨-āĻ¸ā§āĻā§āĻ¨ā§āĻĄāĻžāĻ°āĻŋ-āĻ¸āĻžāĻ°āĻŋāĻŦāĻĻā§āĻ§āĻāĻ°āĻŖ
--āĻā§āĻ¨ā§-āĻŦāĻŋāĻ°ā§āĻ§āĻĒā§āĻ°ā§āĻŖ
--āĻ¨āĻž-āĻŽāĻŋāĻļā§āĻ°
--āĻ¸ā§āĻāĻŽā§āĻ¨ā§āĻ-āĻ āĻŽāĻŋāĻ˛
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻ¸ā§āĻāĻŽā§āĻ¨ā§āĻ-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 25]
--bowtie-n
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: bowtie -v ]
--āĻŽāĻŋāĻ¨-āĻāĻāĻžāĻ°ā§āĻ-āĻāĻ¨ā§āĻā§āĻ°āĻ¨
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 50]
--max-coverage-intron
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 20000]
--āĻŽāĻŋāĻ¨-āĻ¸ā§āĻāĻŽā§āĻ¨ā§āĻ-āĻāĻ¨ā§āĻā§āĻ°āĻ¨
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 50]
--max-segment-intron
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 500000]
--āĻ¨ā§-āĻ¸āĻ°ā§āĻ-āĻŦāĻžāĻŽ
(āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ BAM āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨āĻžāĻā§āĻ-āĻŦāĻžāĻāĻžāĻ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧ āĻ¨āĻž)
--āĻ¨ā§-āĻāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ-āĻŦā§āĻ¯āĻžāĻŽ
(āĻŦā§āĻ¯āĻžāĻŽ āĻĢāĻ°āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻ āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻāĻ°āĻŦā§āĻ¨ āĻ¨āĻžāĨ¤ āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻšāĻ˛ /accepted_hits.sam)
--āĻāĻŋāĻĒ-āĻĢāĻžāĻ¸ā§āĻāĻž-āĻ āĻ°ā§āĻĄāĻžāĻ°
--āĻāĻāĻļāĻŋāĻ-āĻŽā§āĻ¯āĻžāĻĒāĻŋāĻ-āĻāĻ° āĻ āĻ¨ā§āĻŽāĻ¤āĻŋ āĻĻāĻŋāĻ¨
Bowtie2 āĻ¸āĻāĻļā§āĻ˛āĻŋāĻˇā§āĻ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ:
āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¸ā§āĻ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ --āĻ¸āĻ°ā§āĻŦāĻļā§āĻˇ āĻ¸ā§āĻŽāĻž āĻŽā§āĻĄ (āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨ā§āĻ¯āĻŧ āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¤āĻŋāĻāĻāĻ°āĻŖ TopHat2 āĻ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¯āĻŧ āĻ¨āĻž)
--b2-āĻā§āĻŦ āĻĻā§āĻ°ā§āĻ¤
--b2-āĻĻā§āĻ°ā§āĻ¤
--b2-āĻ¸āĻāĻŦā§āĻĻāĻ¨āĻļā§āĻ˛
--b2-āĻā§āĻŦ āĻ¸āĻāĻŦā§āĻĻāĻ¨āĻļā§āĻ˛
āĻĒā§āĻ°āĻžāĻ¨ā§āĻ¤āĻŋāĻāĻāĻ°āĻŖ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
--b2-N
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 0]
--b2-L [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 20]
--b2-i [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: S,1,1.25]
--b2-n-ceil
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: L,0,0.15]
--b2-gbar
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 4]
āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
--b2-mp
, [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 6,2]
--b2-np
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 1]
--b2-rdg
, [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 5,3]
--b2-rfg
, [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 5,3]
--b2-āĻ¸ā§āĻā§āĻ°-āĻŽāĻŋāĻ¨āĻŋāĻ
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: L,-0.6,-0.6]
āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻˇā§āĻāĻžāĻ° āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
--b2-D [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 15]
--b2-R [āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
āĻ˛āĻ¯āĻŧ āĻ¸āĻāĻļā§āĻ˛āĻŋāĻˇā§āĻ āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ:
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻ āĻ¨ā§āĻ¸āĻ¨ā§āĻ§āĻžāĻ¨
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻ ā§āĻ¯āĻžāĻā§āĻāĻ°-āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 20]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻŽāĻŋāĻ¨-āĻā§āĻ˛āĻž
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 10000000]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻĒāĻĄāĻŧāĻž-āĻ āĻŽāĻŋāĻ˛
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻŽāĻžāĻ˛ā§āĻāĻŋāĻ°āĻŋāĻ¯āĻŧāĻžāĻĄāĻ¸
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻŽāĻžāĻ˛ā§āĻāĻŋāĻĒā§āĻ¯āĻŧāĻžāĻ°
[āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻ: 2]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻāĻĒā§āĻā§āĻˇāĻž-āĻā§āĻ°ā§āĻŽā§āĻā§āĻŽ
[āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨, ]
--āĻĢāĻŋāĻāĻļāĻ¨-āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻ¨āĻž-āĻ¸āĻŽāĻžāĻ§āĻžāĻ¨-āĻĻā§āĻŦāĻ¨ā§āĻĻā§āĻŦ
[āĻāĻāĻŋ āĻĒāĻ°ā§āĻā§āĻˇāĻžāĻ° āĻāĻĻā§āĻĻā§āĻļā§āĻ¯ā§]
āĻ¸ā§āĻ¯āĻžāĻŽ āĻļāĻŋāĻ°ā§āĻ˛ā§āĻ āĻ āĻĒāĻļāĻ¨ āĻ¸āĻŽā§āĻš (āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻāĻŽā§āĻŦā§āĻĄāĻŋāĻ āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸āĻŋāĻ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ āĻŽā§āĻāĻžāĻĄāĻžāĻāĻž in āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ):
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻāĻāĻĄāĻŋ
(āĻā§āĻ°ā§āĻĒ āĻāĻāĻĄāĻŋ āĻĒāĻĄāĻŧā§āĻ¨)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻ¨āĻŽā§āĻ¨āĻž
(āĻ¨āĻŽā§āĻ¨āĻž āĻāĻāĻĄāĻŋ)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻ˛āĻžāĻāĻŦā§āĻ°ā§āĻ°āĻŋ
(āĻ˛āĻžāĻāĻŦā§āĻ°ā§āĻ°āĻŋ āĻāĻāĻĄāĻŋ)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻž
(āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛āĻ āĻ¸ā§āĻā§āĻ°āĻŋāĻ, āĻā§āĻ¨ā§ āĻā§āĻ¯āĻžāĻŦ āĻ āĻ¨ā§āĻŽā§āĻĻāĻŋāĻ¤ āĻ¨āĻ¯āĻŧ)
--rg-āĻĒā§āĻ˛ā§āĻ¯āĻžāĻāĻĢāĻ°ā§āĻŽ-āĻāĻāĻ¨āĻŋāĻ
(āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻ˛ā§āĻŽāĻŋāĻ¨āĻž āĻ˛ā§āĻ¨ āĻāĻāĻĄāĻŋ)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻā§āĻ¨ā§āĻĻā§āĻ°
(āĻ āĻ¨ā§āĻā§āĻ°āĻŽ āĻā§āĻ¨ā§āĻĻā§āĻ°ā§āĻ° āĻ¨āĻžāĻŽ)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻ¤āĻžāĻ°āĻŋāĻ
(āĻāĻāĻāĻ¸āĻ 8601 āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸āĻŋāĻ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§āĻ° āĻ¤āĻžāĻ°āĻŋāĻ)
--āĻāĻ°āĻāĻŋ-āĻĒā§āĻ˛ā§āĻ¯āĻžāĻāĻĢāĻ°ā§āĻŽ
(āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸āĻŋāĻ āĻĒā§āĻ˛ā§āĻ¯āĻžāĻāĻĢāĻ°ā§āĻŽ āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻāĻžāĻ°ā§)
āĻŦāĻŋāĻ¸ā§āĻ¤āĻžāĻ°āĻŋāĻ¤ āĻ¸āĻžāĻšāĻžāĻ¯ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻāĻ¨ā§āĻ¯ āĻĻā§āĻā§āĻ¨ http://tophat.cbcb.umd.edu/manual.html
onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ āĻāĻĢā§āĻ¯āĻžāĻ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨
