mia-3ddistance-stats – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

mia-3ddistance-stats – Entfernungsstatistiken für zwei beschriftete Bilder auswerten.

ZUSAMMENFASSUNG

mia-3ddistance-stats -i -r -o [Optionen]

BESCHREIBUNG

mia-3ddistance-stats Dieses Programm wird verwendet, um den Abstand zwischen Gleichen zu ermitteln
beschriftete Bereiche in zwei Bildern. Die Ausgabedatei ist eine CSV-Datei mit den Entfernungen für
jede beschriftete Koordinate im Testbild in der folgenden Form:

Etikett, n-Proben, Abstand, Abstand, ...

Ein einfaches R-Programm, um aus diesen Daten einige Statistiken pro Etikett zu erhalten, würde so aussehen

args <- commandArgs(TRUE)
Daten <- read.csv(args[1], header=FALSE)
for ( i in 1:dim(data)[1] ) {
Zeile <- data[i,]
label <- as.integer(line[1])
end_range <- 2 + as.numeric(line[2])
s <- as.numeric(line[3:end_range])
Ergebnis <- sprintf("%d %8.4f %8.4f %8.4f %8.4f0
Beschriftung, Mittelwert(e), sqrt(var(s)), Median(e), max(s))
Katze(Ergebnis)
}

OPTIONAL

Datei-IO
-i --in-labels=(Eingabe, erforderlich); io
Eingabeetikettenbild. Informationen zu unterstützten Dateitypen finden Sie unter PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-labels=(Eingabe, erforderlich); io
Referenzetikettenbild Für unterstützte Dateitypen siehe PLUGINS:3dimage/io

-l --label-map=(Eingabe); Zeichenfolge
optionale Zuordnung von Etikettennummern

-o --out-file=(Ausgabe, erforderlich); Schnur
Name der Ausgabedatei, in die die Abstände geschrieben werden sollen. Die Ausgabedatei ist eine CSV-Datei,
Enthält die für jedes Etikett aufgeführten Abstände.

Hilfe & Info
-V --verbose=Warnung
Ausführlichkeit der Ausgabe, Ausgabe von Nachrichten mit gegebenem Level und höheren Prioritäten.
Unterstützte Prioritäten beginnend auf der niedrigsten Ebene sind:
Info - Low-Level-Meldungen
Spur - Funktionsaufruf-Trace
scheitern ‐ Testfehler melden
Warnung - Warnungen
Fehler - Fehler melden
debuggen - Debug-Ausgabe
Nachricht - Normale Nachrichten
tödlich - Nur schwerwiegende Fehler melden

--Urheberrechte ©
Copyright-Informationen drucken

-h - Hilfe
diese Hilfe ausdrucken

-? --Verwendungszweck
eine kurze Hilfe ausdrucken

--Version
Versionsnummer drucken und beenden

In Bearbeitung
--threads=-1
Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen. Diese Anzahl sollte niedriger sein
oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne in der Maschine. (-1:
automatische Schätzung). Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen
Anzahl sollte kleiner oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne sein
Die Maschine. (-1: automatische Schätzung).

PLUGINS: 3dbild/io

analysieren 7.5 Bild analysieren

Erkannte Dateierweiterungen: .HDR, .hdr

Unterstützte Elementtypen:
8 Bit ohne Vorzeichen, 16 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma,
Gleitkomma 64 Bit

Datenpool Virtuelle IO zum und vom internen Datenpool

Erkannte Dateierweiterungen: .@

Dicom Dicom-Bildserie als 3D

Erkannte Dateierweiterungen: .DCM, .dcm

Unterstützte Elementtypen:
16 Bit mit Vorzeichen, 16 Bit ohne Vorzeichen

hdf5 HDF5 3D-Bild IO

Erkannte Dateierweiterungen: .H5, .h5

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit,
32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit ohne Vorzeichen, 64 Bit mit Vorzeichen, 64 Bit ohne Vorzeichen, Floating
Punkt 32 Bit, Gleitkomma 64 Bit

Inria INRIA-Bild

Erkannte Dateierweiterungen: .INR, .inr

Unterstützte Elementtypen:
Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 32
Bit, ohne Vorzeichen 32 Bit, Gleitkomma 32 Bit, Gleitkomma 64 Bit

mhd MetaIO 3D-Bild-IO unter Verwendung der VTK-Implementierung (experimentell).

Erkannte Dateierweiterungen: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Unterstützte Elementtypen:
Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 32
Bit, ohne Vorzeichen 32 Bit, Gleitkomma 32 Bit, Gleitkomma 64 Bit

nifti NIFTI-1 3D-Bild IO

Erkannte Dateierweiterungen: .NII, .nii

Unterstützte Elementtypen:
Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 32
Bit, 32 Bit ohne Vorzeichen, 64 Bit mit Vorzeichen, 64 Bit ohne Vorzeichen, Gleitkomma 32
Bit, Gleitkomma 64 Bit

vff VFF Sun Rasterformat

Erkannte Dateierweiterungen: .VFF, .vff

Unterstützte Elementtypen:
unsigned 8 bit, vorzeichenbehaftet 16 bit

Aussicht 3D-Ansicht

Erkannte Dateierweiterungen: .V, .VISTA, .v, .vista

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit,
32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit ohne Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma, 64 Bit Fließkomma
Bit

vti 3D-Bild VTK-XML Ein- und Ausgabe (experimentell).

Erkannte Dateierweiterungen: .VTI, .vti

Unterstützte Elementtypen:
Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 32
Bit, ohne Vorzeichen 32 Bit, Gleitkomma 32 Bit, Gleitkomma 64 Bit

vtk 3D VTK Bild Legacy Ein- und Ausgabe (experimentell).

Erkannte Dateierweiterungen: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Unterstützte Elementtypen:
Binärdaten, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 8 Bit, Vorzeichen 16 Bit, Vorzeichen 16 Bit,
32 Bit mit Vorzeichen, 32 Bit ohne Vorzeichen, 32 Bit Fließkomma, 64 Bit Fließkomma
Bit

BEISPIEL

Bewerten Sie die Abstände für jedes in image.v verfügbare Etikett zu den entsprechenden Etiketten in
Das Bild reference.v speichert das Ergebnis als durch Kommas getrennte Liste von Werten, d. h
Entfernungen.csv.

mia-3ddistance-stats -i image.v -r reference.v -o distances.csv

AUTOR(n)

Gert Wollny

URHEBERRECHT

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mit ABSOLUT KEINE GEWÄHRLEISTUNG und Sie dürfen es unter den Bedingungen der GNU . weitergeben
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Option '--Urheberrecht'.

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