Dies ist die Windows-App namens SeqSelector, deren neueste Version als SeqSelector1.1b.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SeqSelector mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SeqSelector
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BESCHREIBUNG
Das SeqSelector-Toolset ist eine Suite benutzerfreundlicher, plattformunabhängiger Python-Skripte, die die Auswahl von Sequenzen für die gezielte Anreicherung von Bibliotheken der nächsten Generation durch hybridisierungsbasierte Sequenzerfassung erleichtern. Die Skripte erfordern keine Programmierkenntnisse und können auf Genomsequenzen von Modell- und Nicht-Modellarten angewendet werden. Wir schlagen einen Arbeitsablauf vor, bei dem interessierende Gene zunächst aus früheren Studien und öffentlich verfügbaren Datensätzen zur funktionellen Genannotation identifiziert werden. Sobald eine Liste von Kandidatengenen identifiziert wurde, werden ihre Sequenzen aus dem Referenzgenom ausgewählt. Diese Sequenzen werden als Abfrage während einer BLAST-Suche im nicht annotierten Genom einer Nicht-Modellart verwendet und dann werden die entsprechenden Sequenzen zurückgegeben, die zum Entwerfen von Ködern für die hybridisierungsbasierte Sequenzerfassung verwendet werden können.
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/seqselector/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
