Este es el comando gmx-eneconv que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gmx-eneconv - Convertir archivos de energía
SINOPSIS
eneconv gmx [-f [<.edr> [...]]] [-o [<.edr>]] [-b ] [-e ]
[-dt ] [-compensar ] [- [no] settime] [- [no] ordenar]
[- [no] rmdh] [-escalafac ] [-[No hay error]
DESCRIPCIÓN
En nuestro una variedad archivos especificado para el -f opción:
Concatena varios archivos de energía en orden ordenado. En el caso de marcos de tiempo dobles, el
se utiliza uno en el archivo posterior. Especificando -fijar tiempo se le pedirá la hora de inicio
de cada archivo. Los archivos de entrada se toman de la línea de comando, de modo que el comando GMX
eneconv -f * .edr -o Fixed.edr debería hacer el truco.
En nuestro one presentar especificado para -f:
Lee un archivo de energía y escribe otro, aplicando el -dt, -compensar, -t0 y -fijar tiempo
opciones y convertir a un formato diferente si es necesario (indicado por extensiones de archivo).
-fijar tiempo se aplica primero, luego -dt/-compensar seguido por -b y -e para seleccionar qué fotogramas
para escribir
OPCIONES
Opciones para especificar archivos de entrada:
-f [<.edr> [...]] (ener.edr)
Archivo de energía
Opciones para especificar archivos de salida:
-o [<.edr>] (fijo.edr)
Archivo de energía
Otras opciones
-b (-1)
Primera vez para usar
-e (-1)
Última vez para usar
-dt (0)
Solo escriba el cuadro cuando t MOD dt = offset
-compensar (0)
Desplazamiento de tiempo para -dt opción
- [no] settime (no)
Cambiar la hora de inicio de forma interactiva
- [no] ordenar (si)
Ordenar archivos de energía (no marcos)
- [no] rmdh (no)
Eliminar datos del bloque de energía libre
-escalafac (1)
Multiplica el componente de energía por este factor.
-[No hay error (si)
Deténgase ante errores en el archivo
CONOCIDO CUESTIONES
· Al combinar trayectorias, el sigma y E ^ 2 (necesarios para las estadísticas) no se actualizan
correctamente. Solo la energía real es correcta. Por lo tanto, uno tiene que calcular estadísticas en
de otra manera.
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