Este es el comando gt-seq que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gt-seq: analiza los archivos de secuencia dados y construye los archivos de índice correspondientes.
SINOPSIS
gt ss [opción ...] archivo_secuencia [...]
DESCRIPCIÓN
-recrear [si | no]
recrear archivos de índice, incluso si ya existen (predeterminado: no)
-showfasta [si | no]
mostrar todas las secuencias (en formato FASTA) (predeterminado: no)
-showseqnum [propuesta de]
muestra la secuencia con el número dado (en formato FASTA) (predeterminado: indefinido)
-gc-contenido [si | no]
imprimir contenido de GC (para archivos de ADN) (predeterminado: no)
-estado [si | no]
mostrar estadísticas de secuencia (predeterminado: no)
-seqlongituddistri [si | no]
mostrar la distribución de la longitud de la secuencia (predeterminado: no)
-anchura [propuesta de]
establecer el ancho de salida para la impresión de secuencia FASTA (0 deshabilita el formateo) (predeterminado: 0)
-o [nombre de archivo]
redirigir la salida al archivo especificado (predeterminado: indefinido)
-gzip [si | no]
escribir archivo de salida comprimido gzip (predeterminado: no)
-bzip2 [si | no]
escribir archivo de salida comprimido bzip2 (predeterminado: no)
-fuerza [si | no]
forzar la escritura en el archivo de salida (predeterminado: no)
-ayuda
mostrar ayuda y salir
-versión
mostrar información de la versión y salir
PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO
Informar errores a[email protected]>.
Use gt-seq en línea usando los servicios de onworks.net
