Il s'agit de l'application Linux nommée Genobuntu dont la dernière version peut être téléchargée sous Genobuntu_Package.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Genobuntu avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Génobuntu
DESCRIPTION
Genobuntu est un progiciel contenant plus de 70 logiciels et packages orientés NGS. Dans sa version actuelle, Genobuntu prend en charge les outils de pré-assemblage, les assembleurs de génomes ainsi que les outils de post-assemblage.
Des logiciels biologiques couramment utilisés et des exemples de fichiers de script pour différents pipelines d'assemblage ont également été fournis, où les exemples de fichiers de script peuvent être mis à jour pour répondre aux besoins expérimentaux de chacun. Genobuntu tente de réduire le temps et l'énergie nécessaires à la création de stations de travail logicielles et peut également constituer une bonne source d'enseignement pour une salle de classe.
Par conséquent, Genobuntu offre un environnement bien adapté pour les novices et les experts travaillant dans le domaine de l'assemblage du génome.
Fonctionnalités
- Velour
- Mio
- SSAKÉ
- Éoller
- VCAKE
- Abîme
- TOUS LES SENTIERS
- Célera
- SHARCGS
- Tous les chemins
- BID
- TAIPAN
- Édéna
- SAVONdenovo
- Maq
- IDBA-UD
- Nombre de lectures présentes dans la Réf. Séq.
- Simulateur de lecture ART NGS
- HiTEC, FASTQC
- Description Longueur minimale
- SOAPaligneur
- Boîte à outils d'archivage de lecture de séquençage
Audience
Industrie de la santé, science/recherche, éducation, utilisateurs finaux avancés, utilisateurs finaux/ordinateur de bureau, ingénierie
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/genobuntu/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
