यह फास्टएक्स_क्लिपर कमांड है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
fastx_clipper - FASTA/Q क्लिपर
वर्णन
उपयोग: fastx_clipper [-h] [-a एडाप्टर] [-D] [-l N] [-n] [-d N] [-c] [-C] [-o] [-v] [-z]
[-i INFILE] [-o OUTFILE] ए. गॉर्डन द्वारा FASTX टूलकिट 0.0.14 का भाग ([ईमेल संरक्षित])
[-h] = यह सहायक सहायता स्क्रीन।
[-एक एडाप्टर] = एडाप्टर स्ट्रिंग। डिफ़ॉल्ट CCTTAAGG (डमी एडाप्टर) है। [-एल एन] =
एन न्यूक्लियोटाइड से छोटे अनुक्रमों को त्यागें। डिफ़ॉल्ट 5 है। [-डी एन] = रखें
एडॉप्टर और उसके बाद एन बेस।
('-d 0' का उपयोग करना '-d' का बिल्कुल भी उपयोग न करने के समान है। जो कि डिफ़ॉल्ट है)।
[-सी] = गैर-काटे गए अनुक्रमों को हटा दें (अर्थात - केवल वही अनुक्रम रखें जिनमें शामिल है
एडॉप्टर)।
[-सी] = क्लिप किए गए अनुक्रमों को हटा दें (यानी - केवल उन अनुक्रमों को रखें जिनमें शामिल नहीं है
एडॉप्टर)।
[-k] = केवल एडेप्टर अनुक्रमों की रिपोर्ट करें।
[-n] = अज्ञात (एन) न्यूक्लियोटाइड के साथ अनुक्रम रखें। डिफ़ॉल्ट ऐसे को त्यागना है
दृश्यों।
[-v] = वर्बोज़ - अनुक्रमों की रिपोर्ट संख्या।
यदि [-ओ] निर्दिष्ट है,
रिपोर्ट STDOUT पर मुद्रित की जाएगी।
यदि [-o] निर्दिष्ट नहीं है (और आउटपुट STDOUT पर जाता है), तो रिपोर्ट मुद्रित की जाएगी
STDERR.
[-z] = GZIP के साथ आउटपुट को कंप्रेस करें।
[-डी] = डीबग आउटपुट।
[-एमएन] = एन की न्यूनतम एडाप्टर संरेखण लंबाई की आवश्यकता है।
यदि एडाप्टर के साथ एन से कम न्यूक्लियोटाइड संरेखित है - तो इसे क्लिप न करें।
[-i INFILE] = FASTA/Q इनपुट फ़ाइल। डिफ़ॉल्ट STDIN है.
[-ओ आउटफाइल] = फास्टा/क्यू आउटपुट फाइल। डिफ़ॉल्ट एसटीडीओयूटी है।
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके fastx_clipper का ऑनलाइन उपयोग करें
