यह कमांड फिटजीसीपी है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
फिटजीसीपी - जीनोम कवरेज प्रोफाइल में संभाव्यता वितरण के मिश्रण को फिट करें
SYNOPSIS
फिटजीसीपी [विकल्पों] नाम
वर्णन
ईएम-लाइक का उपयोग करके जीनोम कवरेज प्रोफाइल में संभाव्यता वितरण के मिश्रण को फिट करता है
पुनरावृत्त एल्गोरिथ्म।
स्क्रिप्ट इनपुट के रूप में एक एसएएम फ़ाइल का उपयोग करती है और मैपिंग जानकारी को पार्स करती है और एक बनाती है
जीनोम कवरेज प्रोफ़ाइल (जीसीपी)। GCP को एक फ़ाइल में लिखा जाता है, जैसे कि यह चरण हो सकता है
अगली बार छोड़ दिया गया. उपयोगकर्ता एक मिश्रण मॉडल प्रदान करता है जो जीसीपी में फिट किया गया है।
इसके अलावा, उपयोगकर्ता प्रत्येक मॉडल के लिए प्रारंभिक पैरामीटर निर्दिष्ट कर सकता है।
आउटपुट के रूप में, स्क्रिप्ट एक टेक्स्ट फ़ाइल उत्पन्न करती है जिसमें फिट पैरामीटर का अंतिम सेट होता है
फिटिंग प्रक्रिया के बारे में अतिरिक्त जानकारी. एक लॉग फ़ाइल में वर्तमान सेट होता है
पुनरावृत्ति के प्रत्येक चरण में मापदंडों का। यदि अनुरोध किया जाता है, तो जीसीपी और का एक प्लॉट
फिटेड वितरण बनाए जा सकते हैं।
विकल्प
नाम: विश्लेषण करने के लिए एसएएम फ़ाइल का नाम.
-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें
-d जिला, --वितरण=जिला
फिट करने के लिए वितरण. z->शून्य; n: nbinom (MOM); एन: एनबिनोम (एमएलई); पी: बिनोम; टी: पूंछ.
डिफ़ॉल्ट: zn
-i कदम, --पुनरावृत्ति=क्रम
पुनरावृत्तियों की अधिकतम संख्या. डिफ़ॉल्ट: 50
-t टीहृदय --सीमा=टीहृदय
पुनरावृत्ति के लिए अभिसरण सीमा निर्धारित करें। यदि दो के बीच परिवर्तन हो तो रुकें
पुनरावृत्तियाँ THR से कम है। डिफ़ॉल्ट: 0.01
-c कट जाना, --कट जाना=कट जाना
एक कवरेज कटऑफ क्वांटाइल निर्दिष्ट करता है जैसे कि केवल कवरेज मान इसके नीचे हों
मात्रात्मक माने जाते हैं। डिफ़ॉल्ट: 0.95
-p, --भूखंड
फिट किए गए मिश्रण मॉडल का एक प्लॉट बनाएं। डिफ़ॉल्ट: ग़लत
-m अर्थ, --मतलब=मतलब
प्रत्येक पॉइसन या नकारात्मक द्विपद के माध्य के लिए प्रारंभिक मान निर्दिष्ट करता है
वितरण। उपयोग: -m 12.4 -m 16.1 पहले दो के लिए साधन निर्दिष्ट करेगा
गैर-शून्य/पूंछ वितरण। डिफ़ॉल्ट की गणना डेटा से की जाती है.
-a अल्फा, --अल्फा=अल्फा
प्रत्येक वितरण के अनुपातिक अल्फा के लिए प्रारंभिक मान निर्दिष्ट करता है। उपयोग:
तीन वितरणों के लिए -a 0.3 -a 0.3 अनुपात 0.3, 0.3 और 0.4 निर्दिष्ट करता है।
सभी वितरणों के लिए डिफ़ॉल्ट समान अनुपात है।
-l, --लॉग
लॉगिंग करने देना। डिफ़ॉल्ट: ग़लत
--दृश्य केवल GCP देखें. किसी वितरण में फिट नहीं बैठते. कटऑफ का सम्मान करता है (-c) चूक जाना:
झूठा
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन फ़िटजीसीपी का उपयोग करें
