यह कमांड gt-chseqids है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
gt-chseqids - मैपिंग फ़ाइल में दिए गए मैपिंग द्वारा अनुक्रम आईडी बदलें।
SYNOPSIS
gt chseqids [विकल्प...] मैपिंग_फ़ाइल [GFF3_फ़ाइल]
वर्णन
-सॉर्ट [हाँ|नहीं]
अनुक्रम आईडी बदलने के बाद GFF3 सुविधाओं को सॉर्ट करें (मेमोरी खपत है)।
इनपुट फ़ाइल आकार के आनुपातिक) (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-v [हाँ|नहीं]
वर्बोज़ बनें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-o [फ़ाइल का नाम]
आउटपुट को निर्दिष्ट फ़ाइल पर रीडायरेक्ट करें (डिफ़ॉल्ट: अपरिभाषित)
-गज़िप [हाँ|नहीं]
gzip संपीड़ित आउटपुट फ़ाइल लिखें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-बज़िप2 [हाँ|नहीं]
bzip2 संपीड़ित आउटपुट फ़ाइल लिखें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
फोर्स [हाँ|नहीं]
आउटपुट फ़ाइल को लिखने के लिए बाध्य करें (डिफ़ॉल्ट: नहीं)
-मदद
सहायता प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
-संस्करण
संस्करण की जानकारी प्रदर्शित करें और बाहर निकलें
मैपिंग_फ़ाइल के लिए फ़ाइल प्रारूप:
आपूर्ति की गई मैपिंग फ़ाइल "chseqids" नामक मैपिंग तालिका को परिभाषित करती है। यह मैप करता है
GFF3_file में अन्य नामों के लिए अनुक्रम-क्षेत्र प्रविष्टियाँ दी गई हैं। इसे इस प्रकार परिभाषित किया जा सकता है
इस प्रकार है:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
जब इस उदाहरण का उपयोग किया जाता है, तो सभी अनुक्रम आईडी "chr1" को "seq1" और सभी में बदल दिया जाएगा
अनुक्रम आईडी "chr2" से "seq2"।
रिपोर्टिंग बग
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onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन gt-chseqids का उपयोग करें
