आरडीपी-संरेखण - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

आरडीपी-संरेखण: - राइबोसोमल डेटाबेस प्रोजेक्ट (आरडीपी) संरेखण उपकरण पैकेज

SYNOPSIS

आरडीपी-संरेखण

वर्णन

संरेखण उपकरण पैकेज में जोड़ीवार परिभाषित समुदाय विश्लेषण करने के लिए आदेश शामिल हैं
संरेखण और छिपा हुआ मार्कोव मॉडल (HMMER3 मॉडल, कोई प्रशिक्षण नहीं)।

विकल्प

की सूची उपकमांड:

संरेखण-विलय
- संरेखण मर्ज करें

जोड़ीवार-knn
- जोड़ीवार संरेखण द्वारा k-निकटतम-पड़ोसियों की गणना करें

तुलना-त्रुटि-प्रकार
- तुलना करने वाले अनुक्रमों में सम्मिलन, विलोपन और प्रतिस्थापन त्रुटियों का पता लगाएं
संदर्भ अनुक्रम

एलाइन-न्यूक्ल-टू-प्रोट
- एक अनुक्रम संरेखण को प्रोटीन अनुक्रम से न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम में स्थानांतरित करें

आरएम-आंशिकसेक
- संदर्भ अनुक्रमों के जोड़ीवार संरेखण के आधार पर आंशिक अनुक्रम हटाएं

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन rdp-संरेखण का उपयोग करें