Ini adalah aplikasi Linux bernama MICA-aligner yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai mica-GPLv3.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama MICA-aligner dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
pelurus MICA
Ad
DESKRIPSI
Kode Terbaru di GitHub:
https://github.com/aquaskyline/MICA-aligner
Untuk lebih memanfaatkan komputer berkemampuan MIC untuk analisis data NGS, kami mengembangkan MICA aligner baca pendek baru yang dioptimalkan mengingat keterbatasan MIC dan paralelisme ekstra di dalam setiap inti MIC. Eksperimen dalam menyelaraskan pembacaan akhir berpasangan 150bp menunjukkan bahwa MICA menggunakan satu papan MIC ~4.85 kali lebih cepat daripada BWA-MEM berbasis CPU (multi-inti) dan kecepatan yang hampir sama dengan SOAP3-dp berbasis GPU. Selain itu, kesederhanaan MICA memungkinkan peningkatan yang sangat efisien ketika beberapa papan MIC digunakan dalam sebuah node (3 kartu memberikan percepatan 14 kali lipat dibandingkan BWA-MEM 6-core).
Para penonton
Sains/Penelitian, Pendidikan, Teknik
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
C + +
Lingkungan Basis Data
File datar
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/mica-aligner/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
