Questa è l'app Linux denominata GNomEx la cui ultima versione può essere scaricata come gnomex_tomcat_5.35.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata GNomEx con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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GNomEx
DESCRIZIONE
Il nostro codice sorgente è ora su GitHub: https://github.com/hci-gnomex/gnomex. Fare riferimento a GitHub per il codice più recente.
GNomEx è LIMS genomico e repository di dati. Contiene esperimenti annotati e analisi a valle e fornisce tracce di dati ai browser del genoma più diffusi come IGB, IGV e browser del genoma UCSC. Il LIMS gestisce tutti gli aspetti dell'esperimento, dall'ordine alla consegna dei risultati. Le piattaforme sperimentali supportate includono Illumina HiSeq, MiSeq, iScan, sequenziamento ABI Sanger, Affy e Agilent Microarrays, Sequenom MassArray e Bioanalyzer.
GNomEx è un'applicazione web con un'interfaccia utente client Flash e un backend Java che gira su Apache Tomcat. MySQL viene utilizzato per il database, sebbene sia possibile utilizzare qualsiasi RDBMS moderno.
Caratteristiche
- Configurabile per molte diverse piattaforme di esperimento e sequenziamento
- Supporto per più strutture principali
- Fatturazione automatizzata/notifiche ai clienti
- Annotazioni configurabili per esperimenti, campioni o analisi
- Visualizzatore di file ABI integrato
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Web based-
Linguaggio di programmazione
Java, flessibile
Ambiente database
MySQL
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/gnomex/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
