Questa è l'app di Windows denominata Hadoop-BAM la cui ultima versione può essere scaricata come hadoop-bam-7.1.0.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata Hadoop-BAM con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
Hadoop-BAM
Ad
DESCRIZIONE
Hadoop-BAM è una libreria Java per la manipolazione di file nei comuni formati bioinformatici utilizzando il framework Hadoop MapReduce con Picard SAM JDK e strumenti da riga di comando simili a SAMtools.
I formati di file attualmente supportati sono BAM, SAM, FASTQ, FASTA, QSEQ, BCF e VCF.
Per una descrizione più ampia e di alto livello di Hadoop-BAM, fare riferimento all'articolo "Hadoop-BAM: direttamente manipolare i dati di sequenziamento di nuova generazione nel cloud" in Bioinformatics Volume 28 Issue 6 pp. 876-877, disponibile online all'indirizzo: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts054
Nota che la parte della libreria di Hadoop-BAM è principalmente per sviluppatori con esperienza nell'uso di Hadoop. Gli strumenti della riga di comando di Hadoop-BAM dovrebbero essere comprensibili a tutti gli utenti, ma hanno un ambito limitato.
Vedere il progetto SeqPig per un'interfaccia di livello superiore ai formati di file supportati da Hadoop-BAM: http://seqpig.sourceforge.net
Vedere Sigillo per strumenti di allineamento della lettura basati su Hadoop, Sigillo: http://biodoop-seal.sourceforge.net
Pubblico
Sviluppatori
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
